1931年冬，日本关东军河野中佐指挥着一个骑兵大队，在辽西一带多次烧杀掳掠，当地百姓深受其害。为了对付日本鬼子这支骑兵，抗日义勇军总司令黄显声将军决定组建一支骑兵队伍。组建骑兵部队，首先要有战马，于是，黄将军就派他的副官孙继先到内蒙古买战马。
孙继先和几名随从化装成马贩子，在内蒙古大草原上风餐露宿奔波了一个多月，终于买到了两百多匹膘肥体壮的战马。谁知，当他们赶着这群战马返回义勇军驻地的途中，不幸遇上了小鬼子河野的骑兵大队，都被抓了起来。
孙继先一行人等连同两百多匹战马，都被关在一个大院子里，因为河野不知道这些人的真实身份，就把他们留下来当马夫饲养战马。
当晚，孙继先把几名随从召集到身边说：“两百匹战马，能组建一个骑兵团，如果到了河野手中，辽西人民必将遭到更大的灾难，我们一定要想办法把这些战马带回义勇军驻地。”
一个名叫刘二的随从为难地说：“我们几个手无寸铁，要在几百名全副武装的日本骑兵眼皮子底下赶走两百匹战马，你不是在做梦吧！”
孙继先胸有成竹地说：“你们大概还不知道吧，我孙继先就是马神的传人！”
随从们都万分惊讶地说：“你就是马神的传人？”
关于马神的传说，在辽西一带家喻户晓。
早在明朝时期，倭寇屡屡从海上进入我国境内烧杀抢掠，沿海百姓深受其害。戚继光将军率领明朝军队，多次给这些日本侵略者以毁灭性的打击，大部分倭寇都被赶出了中国。可是，有一小股倭寇骑兵，却流窜到辽西一带，凭借着骑兵机动性强的优势，一次次躲过了明军的追杀，继续抢夺财物，奸淫烧杀，无恶不作。
那年月大明朝腐败成风，财政非常困难，戚继光的军队连买战马的钱都没有。
就在戚继光苦于没法对付这支倭寇骑兵的时候，一位姓孙的马贩子来到明军的中军大帐。这个马贩子自称是马神的传人，说他有能力消灭这支倭寇骑兵。
戚继光问道：“你有什么办法灭掉这支倭寇骑兵？”
马贩子说：“这是我们孙家的祖传秘方，我只能对你一个人说。”
戚继光让所有的人退出中军大帐，然后迫不及待地说：“你说吧。”
没有人知道这个姓孙的究竟跟戚继光说了些什么，半个时辰后，戚继光手挽手亲自把这位马贩子送出明军大营，临别时还亲自把他扶上马双手抱拳说：“这支倭寇骑兵能否歼灭，就全靠您了！”
因为明太祖朱元璋最恨商人，明朝商人的社会地位是很低的，戚继光这位战功显赫的封疆大吏，能对一个马贩子行此大礼，足以看出马贩子歼灭倭寇骑兵的方法，已经让戚继光心服口服了。
后来这个姓孙的马贩子装扮成马夫，混进了倭寇的骑兵队伍。
几天后，戚继光就得到马贩子送来的情报：这支倭寇骑兵正在某地烧杀抢掠中国百姓。戚继光立即带兵前去围剿，倭寇骑兵们仍和往常一样，根本就没把明军当回事，他们倚仗着骑兵速度快的优势，把抢夺的财物和女人放在马背上，快马加鞭扬长而去。
就在这时，突然，不知从什么地方传来一阵非常奇特的口哨声，那个姓孙的马贩子就像从天上掉下来似的，突然出现在这支倭寇骑兵的面前！
“吱—”在这婉转悠扬的口哨声中，倭寇的战马就像中了魔法似的，突然疯狂地跳跃起来，倭寇一个个被摔下马，眨眼之间，这些耀武扬威的侵略者就趴在地上鬼哭狼嚎般哭爹喊娘了！
追上来的明军，不费吹灰之力，就把这些作恶多端的倭寇全部歼灭。
关于马神帮助戚继光抗击倭寇的传说，后来有好几个版本。
有的说当年马神混进倭寇骑兵队伍后，给所有的战马喂了一种祖传的兽药，战马在药力的作用下变得狂躁不安，把倭寇摔下了马；也有一个版本说，马神会说“马语”，那奇特的口哨声就是告诉战马，它们背上驮的是坏蛋，把这些坏蛋统统摔死……
究竟哪个版本是真的，至今也没人能说清楚。
当天晚上，孙继先借喂马的机会，俯在每一匹战马的耳边，嘀嘀咕咕不知说了些什么，第二天一大早，所有的战马突然都“绝食”了！一连几天两百匹马不吃也不喝，河野气得哇哇乱叫，命令随队兽医一定要查出原因。
兽医又是测体温，又是用听诊器在马肚子上一遍一遍地听，折腾了好几天，也没查出什么来，灌药、打针全都无济于事，眼看着两百匹战马一天天瘦下来，用不了多久就要活活饿死了。
河野急得吃不下睡不着，比他亲娘老子病了还着急！
恰在这时，关东军司令部命令这支骑兵大队，前往吉林围剿风起云涌的抗日武装，河野只得留下兽医和孙继先等几名马夫照看这些“病马”，他带着队伍出发了。
大队日本鬼子前脚刚走，孙继先就兴奋地说：“我们的机会来了！”
刘二说：“这些战马饿得走路都打晃了，机会来了又有啥用？”
孙继先说：“你不要忘了，我可是马神的传人啊！”
这天，孙继先利用喂马的机会，再次俯在每一匹战马的耳边，嘀嘀咕咕不知说了些什么，第二天一大早，突然所有的战马都大口大口地吃起了马料。战马不治而愈，日本兽医欣喜若狂，这可是一个向关东军最高司令部邀功请赏的绝好机会！
当晚，日本兽医喝得酩酊大醉，孙继先和刘二等人不费吹灰之力，就把这个日本鬼子捆了个结结实实。
此时此刻，日本兽医才恍然大悟：这些战马怎么会突然得病？又突然痊愈？一定是这几个中国人捣的鬼！
孙继先严肃地对这个日本兽医说：“小日本儿，你遇上了我马神的后人，就自认倒霉吧。这些战马是抗日义勇军出钱买的，现在要物归原主喽！”
无巧不成书，这个日本兽医祖上也当过倭寇，当年马神帮助戚继光剿灭倭寇的传说，他也听说过，既然遇上了马神的后人，这件事也只能自认倒霉了。
事后刘二多次对孙继先说：“你就哼几句‘马语’让我听听呗！”
孙继先每次都是淡然一笑说：“这是孙家的祖传秘方，不能外传。”
孙继先在一次战斗中受了重伤，不得不离开抗日义勇军，回到辽西老家当了一名专治马病的兽医。刘二也在那次战斗中失踪了，没人知道他去了什么地方。
光阴荏苒，转眼之间到了抗日战争最艰苦的1943年。
兵荒马乱，老百姓没有几家能养得起马的，孙继先这个马神的传人，只能惨淡经营，勉强度日。这天，因为接连下了好几天大雨，没人前来给马治病，孙继先一个人正在家中喝闷酒的时候，刘二竟然风尘仆仆地出现在他面前。
孙继先问道：“这么多年，你到哪里去了，怎么一点音信也没有？”
刘二长叹一声说：“唉，一言难尽啊！”
刘二说，那次义勇军战败后，他躲在一具战友的尸体下面，才捡了一条小命。从战场上逃出来，就投奔了在北平的一个亲戚，这些年一直帮着这个亲戚做生意。他这次到辽西，是处理一些生意上的事情，顺便看望一下老朋友。
孙继先感动地说：“你知道吗？这些年我是多么想念你啊！”
刘二拿出一瓶好酒说：“我也想念你啊！来来来，这是我从北平带来的一瓶好酒，我那个亲戚说这是当年皇宫御膳房的一个御厨送给他的，你我喝个一醉方休。”
两人边喝边聊，自然就谈到了那次连人带马被日本鬼子河野扣押的事，刘二有意无意地随口问道：“继先老弟，我一直想不明白，难道你真的会说马语？”
孙继先说：“我哪里会说什么马语啊，其实那都是—”
就在这时，一名佩戴大佐军衔的日本指挥官，带着几个日本鬼子，气势汹汹地闯了进来。孙继先一眼就认出来了，这个日本大佐就是当年的骑兵大队长河野。
刘二一见到河野，立刻就像耗子见了猫似的，点头哈腰地说：“太君！”
孙继先满腹疑惑地看着刘二问道：“这是怎么回事？”
刘二脸上一阵红一阵白地说：“人往高处走，水往低处流。我现在是日本关东军骑兵司令河野大佐的养马顾问了！”
原来在那次战斗中，刘二负伤后被日本鬼子俘虏了，因为经不住严刑拷打，就变节投降，成了一名汉奸，他刚才所说的什么在北平做生意的事，都是骗人的鬼话。
孙继先愤怒地骂道：“你这个无耻的汉奸！说，到我这里干什么来了？”
刘二说：“河野大佐听说你们孙家有一本祖传的‘马神秘方’，我就是专为这件事来的。识时务者为俊杰，我劝你老老实实把你家的祖传秘方交出来，大日本皇军可不是好惹的！”
孙继先冷笑一声说：“我要是不交呢？”
刘二突然一阵狂笑：“哈哈……孙继先，这秘方你交也得交，不交也得交。不瞒你说，我今天在你喝的酒里面下了一种大日本皇军秘制的毒药，你要是不跟皇军合作，明年的今天就是你的忌日！”
孙继先万分惊讶地说：“你为什么要在酒里下毒？”
刘二说：“不这样，你能把祖传秘方交出来吗？”
河野也威胁说：“交出秘方，解药的给，不交秘方，我就砍掉你的脑袋！”
孙继先感到肚子里疼痛难忍，豆大的汗珠滚了下来。他知道刘二说的不是假话，看样子这个狗汉奸把什么都跟日本鬼子说了。
孙继先疼得在地上直打滚儿，终于难忍疼痛的折磨，慢慢说：“马神的祖传秘方……藏在辽河对岸我的家里，只要给我解药，我就带你们去取……”
狡猾的河野说：“我见到马神的祖传秘方，立刻就给你解药！”
刘二立刻找来一条渡船，河野亲自带领十几名鬼子押着孙继先，连同十几匹战马登上了渡船。
暴雨后的大辽河波涛汹涌，渡船在风浪中摇摇晃晃向河对岸驶去。当渡船行驶到河中心时，孙继先突然从兜里掏出一个小药葫芦，只见他迅速拧开药葫芦的盖子，猛然向空中撒去，霎时间，一股奇特的芳香迅速漫延开来。
刘二大叫一声：“大家小心！”
河野也意识到上了孙继先的当，可是，还没等他拔出战刀，渡船上的战马闻到这奇特的香味，立刻就像被打了兴奋剂似的，全都变得骚动不安起来，有的相互厮咬、有的相互踢打、有的甚至挣脱缰绳，不顾一切地往河里跳……混乱中，孙继先纵身跳进波涛汹涌的河水中……不大一会儿，渡船就翻了，河野、刘二和十几名鬼子，连同战马全部淹死了！若干年后，孙家的老屋拆迁，人们在一段夹壁墙里发现了一本残缺不全的《马神秘方》。因为年代久远，且又多处被鼠咬虫吃，人们只能从支离破碎的残缺文字中看到一些草药名字，还有用宫、商、角、徵、羽五声调式标出的疑似“马语”的曲谱……
因为曲谱残缺不全，再加上孙继先家已经没有后人了，所以也就无人能读懂这些“马语”，这本《马神秘方》也就成了没人能读懂的天书。